Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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KRTAP4-16G5E9R7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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KRTAP4-16G5E9R7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-16G5E9R7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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