Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms