Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms