Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms