Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms