Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms