Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RNF7Q9UBF6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RNF7Q9UBF6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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