Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms