Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TDP1Q9NUW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TDP1Q9NUW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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