Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEPPQ9NTK1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms