Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms