Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms