Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF1Q9H7N4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms