Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms