Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms