Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms