Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB2BQ9BVA1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms