Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms