Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCF12Q99081 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCF12Q99081 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCF12Q99081 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCF12Q99081 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms