Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms