Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms