Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms