Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms