Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms