Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC120Q96HB5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms