Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms