Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms