Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC21AQ8NDW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC21AQ8NDW8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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