Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CARMIL3Q8ND23 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms