Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOT1Q8IXI2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms