Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms