Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL1

USP54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, humanhuman

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Length 1,684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54Q70EL1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP54Q70EL1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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