Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms