Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms