Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms