Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD40Q6AI12 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms