Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms