Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDSS1Q5T2R2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms