Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LACTB2Q53H82 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LACTB2Q53H82 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms