Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms