Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms