Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFNL1Q499Z3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms