Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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