Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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