Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PCSK7Q16549 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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