Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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