Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms