Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF13Q15543 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms