Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PUM3Q15397 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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