Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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